孫士毅在鎮(zhèn)南關(guān)，收容逃回的官兵，不到清軍總額的一半，大量的糧械火藥丟失殆盡。從云南開化廳馬白關(guān)出兵，侵入安南宣化鎮(zhèn)的烏大經(jīng)部，遭到農(nóng)民起義軍反擊后，也倉(cāng)慌逃回國(guó)內(nèi)。

安南之役以清朝的失敗而告終。它沒(méi)有實(shí)現(xiàn)清朝預(yù)期的戰(zhàn)略目標(biāo)“為黎氏復(fù)國(guó)，消滅阮氏集團(tuán)?！?/p>

安南之役敗北，大批清朝將士殞命安南。乾隆皇帝令敗將孫士毅解任回京，調(diào)?？蛋惭a(bǔ)授兩廣總督，相機(jī)辦理安南事宜。

“安南之役”兩國(guó)交兵，使清前期的清安關(guān)系蒙上了一層陰影。但它并未長(zhǎng)久的影響清安關(guān)系的正常發(fā)展。隨著兩國(guó)政策的逐步調(diào)整，很快就驅(qū)除了戰(zhàn)爭(zhēng)的陰霾，迎來(lái)了兩國(guó)關(guān)系發(fā)展的燦爛前景。乾隆皇帝決計(jì)不再調(diào)兵進(jìn)剿安南。福康安也與乾隆皇帝的想法相吻合。